A szájüregben elkezdődik, majd a gyomorban, pepszin, tripszin, katepszin enzimek segítségével a vékonybélben válik teljessé. A vékonybél mindhárom szakaszán létrejön a fehérjefelszívódás folyamata. A leghatékonyabban a di- és tripeptidek formájában hasznosulnak az aminosavak, melyek felszívódását számos tápanyag képes befolyásolni. Ezek egyike a teában, kávéban, egyes vörösborfajtában fellelhető tannin, melyet az emésztőnedvekben levő enzimek hatásának csökkentésével éri el. Így képes a hasnyálmirigy által termelt Tripszint és a szénhidrátbontó Amiláz enzim aktivitását csökkenti.

Az élelmi rostokat tartalmazó ételekben, azaz a gabonafélékben, babban, borsóban találjuk az ún. fitátokat, melyek képesek megkötni a fehérjéket (ezzel együtt a szénhidrátokat, a kalciumot és cinket is), így a szokásosnál kevesebb hasznosul. Jóllehet akadnak olyan élelmiszerek, pl. az ananász, amely bromelin nevű enzimtartalmánál fogva serkenti a fehérjék emésztését.
A főzés is megváltoztatja a fehérjék felszívódását. Enyhe hőkezelés hatására a fehérjék kisebb aminosavegységekre szakadnak, di- és tripeptidekre, mely hatékonyabbá teszi a felszívódást. Ezzel ellentétben a hosszú ideig tartó sütés, főzés a fehérjék bonthatóságát csökkenti.

Az aránytalanul sok fehérje fogyasztása csökkenti a kalcium, réz, cink felszívódását különösen akkor, ha táplálkozásunk kevés élelmi rostot tartalmaz.

Az aminosavak hatékony felhasználását, izmainkba való beépülését a hormonrendszeren kívül a következő anyagok biztosítják a táplálék útján:

• amilóz
• dextrinek, maltóz
• laktóz
• zsiradék
• kálium
• magnézium